Die agnion Gruppe wurde 2007 gemeinsam mit dem Münchener Investor Munich Venture Partners und dem amerikanischem Investor, Kleiner Perkins Caufield & Byers, auf Initiative des Firmengründers Professor Dr.‐Ing. Jürgen Karl (heute Leitung Lehrstuhl für Energieverfahrenstechnik) gegründet.

2009 konnte mit Wellington Partners ein weiterer renommierter Investor gewonnen werden.

Im Mai 2011 wurde mit der amerikanischen Waste Management Inc. ein vierter strategischer Investor begrüßt.