Il gruppo agnion è stato fondato insieme alla società di investimenti di Monaco Munich Venture Partners e all’investitore americano Kleiner Perkins Caufield & Byers, su iniziativa del fondatore dell'azienda, il professore Dott. Ing. Jürgen Karl (attualmente direttore per del reparto Tecnologia dei processi energetici, Università Erlangen/Norimberga).

Nel 2009 è stato acquisito un altro rinomato investitore Wellington Partners.

In maggio 2011 è stato accolto un quarto investitore strategico, la società americana  Waste Management Inc.